人类的每一个蛋白质随时都像在进行着一场抛开的战争,蛋白质核是少将部,蛋白质质是战线。
六十年前,罗宾逊·沃克(Francis Crick)的“当中心法则”( DNA磷酸化形同RNA,先翻形同氨基酸)现在一直是蛋白质协同作战的绝对军规,国家机密(端粒酶)必须从少将DNA先到RNA的军队,先到“物资”氨基酸。
少将团DNA:掌握国家机密(端粒酶),极为重要,所以DNA都不请假,只是在少将部里上级协同作战命令,指挥统领RNA的军队,DNA把国家机密转交RNA的军队当中的“在此之前军”——早先RNA(mRNA),由它们把这些密码带回蛋白质质当中加工过渡到物资氨基酸,让氨基酸把握药理学系统,反击“敌”。
由于氨基酸是由mRNA所区块的,也就是大家都广为看重的区块RNA,因此我们称这些mRNA为RNA的军队当中的“在此之前军”。“在此之前军”mRNA是RNA的军队侄部队,系统是在蛋白分子合形同更进一步当中,作为“早先”分子,将原核生物DNA的端粒酶(即脱氧核糖核酸依次顺序)传递至RNA,实现端粒酶向氨基酸分子的转形同。作为氨基酸合形同的模板,“在此之前军”早先RNA(mRNA)粗大期以来一直是主要的数据分析方法重点,但在RNA的军队当中,除了“在此之前军”,还有很多“非在此之前军”,或许可以称做“杂牌军”——非区块RNA(ncRNA)。
如大多数的军队一样,“在此之前军”早先RNA 一直被忽视是主要的协同作战力量,那些“非在此之前军”ncRNA的找到是一个滞后的更进一步,并且粗大期被埋怨,忽视是大量磷酸化的副产物,是原核生物上的“垃圾场”或“暗物质”,药理学意义小,没法协同作战潜能。
但是,时来运转,在1950年代找到了转录当中的重要非区块RNA,即RNARNA(rRNA)和发运RNA(tRNA),它们虽都是区块RNA,但在氨基酸合形同更进一步则有极其重要的发挥作用,1980年代找到了小核(sn)RNA,1993年和2000年在秀丽隐杆线虫当中分别找到了微量RNA(miRNA),随后各种非区块RNA慢慢地浮出。2003年完形同了人类原核生物计划(HGP),在哺乳动物当中找到了非常丰富的粗大非区块RNA(lncRNA),同时科学家们也惊奇地找到人类原核生物当中能区块蛋白的DNA只占整个原核生物的2%,其余98%的DNA序列普遍被忽视是“垃圾场”和“噪音”,因为它们大多数仅有磷酸化形同RNA,而不继续翻形同氨基酸。2005年启动的ENCODE(DNA元素百科全书)项目及其不断更新简报证明人类原核生物剩余的“垃圾场”序列将近 80% 都是有系统的,带有磷酸化形同ncRNA的潜能。这些找到揭示了RNA的军队当中一个毫无疑问的非区块当今——在RNA的军队当中混有大量的“非在此之前军”ncRNA。
那么,什么都是区块RNA呢?
区块氨基酸的mRNA是区块RNA,相反,那些不区块氨基酸的RNA被称做非区块RNA。非区块RNA(non-coding RNA,ncRNA),指的是不被翻形同氨基酸的一类小RNA,ncRNA的胺基酸(nucleotide,nt)一般不粗大。这些RNA的共同特点是都能从原核生物上磷酸化而来,但是不翻形同氨基酸,在RNA 水平上就能履行各自的药理学系统了。
那么,非区块RNA军队增编有哪些军种呢?
首先要详述的一点是,在广义的类群上,目前大家比较看重的RNARNA(rRNA)和发运RNA(tRNA)也是统称非区块RNA的军队的。tRNA分子较小,其主要发挥作用是在氨基酸合形同当中发运。rRNA是RNA的组分之一,参与氨基酸的合形同。
其次,有一种类群原理是将非区块RNA 从粗大度上去分界为三类:
第一类相等50 nt,主要之外微量RNA(miRNA),小干扰RNA(siRNA)等等;
第二类为50 nt到500 nt, 除了rRNA与tRNA,还之外snRNA(小核RNA),snoRNA(小核仁RNA)等等;
第三类远大于500 nt,之外粗大的mRNA-like 的非区块RNA,粗大的不带polyA 尾巴的非区块RNA等等。
另一种类群原理是将它们分为两大类,即粗大非区块RNA和短非区块RNA。粗大非区块RNA(lncRNA)的结构和系统近似于mRNA,但它们不像mRNA那样可以翻形同蛋白,只是调节与它们临近的mRNA的磷酸化和翻译。短非区块RNA有很多种,如miRNA,siRNA,snRNA,snoRNA等等。
ncRNA基因数量更大,除上述几种ncRNA外,转移一早先RNA(tmRNA)、小胞浆RNA(seRNA)、讯号识别颗粒RNA等也都统称ncRNA, 近年来,人们对ncRNA的数据分析方法极大加快了RNA组学(RNomics)的数据分析方法向前,ncRNA比在此之后或许的要非常丰富得多,重要得多,但是ncRNA当中仍有大量的未知RNA有待人们去找到。可见,“非在此之前军”的增编还是很多的,并且军种还在扩编,各军各司其职,在协同作战当中把握重要发挥作用。
那么,“非在此之前军”在蛋白质战线上(生命更进一步当中)把握什么发挥作用呢?
随着数据分析方法的深入,“非在此之前军”ncRNA在蛋白质战线上的协同作战潜能还是杠杠的,它们的协同作战潜能或许并不逊色于“在此之前军”mRNA,非区块RNA不仅有不是RNA的军队当中的垃圾场部队,反而“非在此之前军”的扩编已经席卷了所有的活生物体,它们在真核原核生物的转录和重塑当中都带有极高的发挥作用。虽是“非在此之前军”,但它们是战线上最重要的调制部队,或者说是护军,没法非区块RNA把握调节发挥作用,少将团DNA就无法指挥物资氨基酸,氨基酸就没法像现在这样把握正常的药理学系统,蛋白质战线就不会取得粗大久的胜利。越来越多的证词表明,ncRNA分析方法已形同为依托趋势,ncRNA广泛参与生命现象的各个环节,如生粗大、分化、发育、免疫,甚至在的过渡到当中也带有重要的介导发挥作用,它们已被确定为各种癌症型式的诱发系数和诱发传动装置系数。
总之,“正不在此之前不重要”,“黑家猫白家猫能抓兔子就是好家猫”。大家不必忽视RNA的军队当中的“非在此之前军”——非区块RNA的发挥作用咯。
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